全自动生化分析仪厂家认为引起肝硬化的病因很多，在我国以乙型、丙型病毒性肝炎为主，而在北美、西欧则以酒精中毒为多。一般来说有以下9大类原因。
(1)病毒性肝炎：虽然长期以来对病毒性肝炎是否引起肝硬化一直有争议，但目前已肯定乙型病毒性肝炎与丙型病毒性肝炎可导致肝硬化，而且是我国肝硬化的主要发病原因。虽然乙肝肝硬化的发病率难以明确肯定，但一般认为HBsAg/HBeAg持续阳性的慢性肝炎有30%～50%可出现肝硬化。丙肝约有70%的患者呈慢性经过，其中10%～30%最终发生肝硬化。
(2)血吸虫感染：反复或长期的血吸虫感染可引起肝脏门脉区的结缔组织增生，形成血吸虫病性肝纤维化，过去也称血吸虫性肝硬化。同时，晚期血吸虫病病人有半数以上乙肝病毒标志物阳性，说明不少病人是由血吸虫与乙肝重叠感染引起混合性肝硬化。
(3)慢性酒精中毒：长期以来，慢性酒精中毒在西方国家一直是主要原因，在欧洲约占所有肝硬化的42%，美洲占66%。近年来，国内酒精性肝硬化也日见增多。资料表明大量饮酒20年以上者，40%～50%将发生肝硬化。
(4)遗传性代谢缺陷：由于遗传性酶的缺陷，使某些物质的代谢障碍，致使这些物质在肝脏沉积，引起肝脏形态结构和功能的改变，并发展为肝硬化。如铜代谢障碍引起的肝豆状核变性，铁代谢障碍引起的血色病，糖代谢紊乱引起的半乳糖血症等，均可造成肝损伤并引起肝硬化等。
(5)药物或毒物：大多数药物在肝内进行生物转化与清除，长期服用某些药物，如双醋酚汀、辛可芬、甲基多巴等，可引起药物性肝损害并可演变为肝硬化。近年来由于药物种类增多，使药物性肝损害增多，或者反复接触某些化学毒物，如四氯化碳、磷、砷剂，也可引起中毒性肝炎或肝硬化。
(6)胆汁淤积：肝内或肝外胆管长期阻塞或胆汁淤积，可引起肝细胞变性、坏死和纤维增生，并发展为肝硬化。：原因不明的肝内胆管非化脓性炎症引起的肝硬化称之为原发性胆汁性肝硬化，由总胆管结石、狭窄、肝外肿瘤、慢性炎症等原因引起的称为继发性胆汁性肝硬化。
(7)淤血：慢性充血性右心衰竭引起小叶肝窦扩张与淤血，以及心捧出量减少，肝供养减少，使小叶中央区网状纤维支架塌陷及增生，最终可导致肝硬化。其中最常见的病因为风湿性心脏病_其次为缩窄性心包炎，肺源性心脏病。
(8)其他：慢性肠道炎症如溃疡性结肠炎、全身结缔组织疾病等，均可引起肝细胞变性、坏死，甚至演变为肝硬化。单纯性营养不良是否能导致肝硬化一直持有争议，但多数学者认为其可导致肝细胞对其他致病因素抵抗力的降低，因而是一间接病因。
(9)隐原性肝硬化：为原因不明的肝硬化中常见类型，病理学改变与肝炎类似。近年来随着特异性诊断方法的建立与提高，约有1/4隐原性肝硬化为病毒性肝炎引起。
应该说明的是以上病因常常可以相互为患，如酒精性、血吸虫性肝病患者容易感染感应病毒，最后导致肝炎性、血吸虫性或酒精性肝硬化。
